隨著層流手術室越來越廣泛，其各項問題亦開始日益凸顯。青海層流手術室空調系統應控制相應等級用房的室內溫度、濕度、塵埃、細菌、有害氣體濃度以及氣流分布，以保證室內人員所需的新風量，維持室內外合理的壓力梯度，滿足潔凈手術部保障體系的要求，創造一個理想的無菌手術環境。青海層流手術室空調系統具有送風量大、阻力高、相對冷熱負荷小和送風量差小的特點。

所謂高級別層流手術室即是指潔凈等級在千級以上的層流手術室，主要依賴于強大的空調送風量得以實現。譬如說，同樣面積的層流手術室，百級的空調風量就是十萬級的3.4倍、萬級的2.25倍等。但是，相較使用頻率遠，高級別層流手術室卻要明顯低于低級別手術室。因此就此看來，一個空調系統無論是同時負擔多個高級別層流手術室，還是同時負擔一個高級別和多個低級別手術室，都會使得其長時間處于“大馬拉小車”的運行狀態。　　

假設說一個空調系統同時負擔一個百級和兩個萬級層流手術室，只要百級層流手術室不使用，其系統設計運行風量就會至少大于此時實際所需風量的112%，亦即此時空調系統所需實際風量僅為原系統設計風量的47%。而且再加之此種潔凈模式控制之下的青海層流手術室，其風量變化不宜采用變頻調速方式進行調節，而通過調節總風閥調節風量的方式又并不顯節能。因此，通過層層比較，高級別層流手術室都應該采取單間單配的形式設置凈化空調系統。　　

為了提高能源的綜合利用率，層流手術室的空調系統應在保護環境和滿足潔凈手術部保障體系要求的前提下，不斷提高節能水平。通過優化潔凈空調系統的節能設計，合理配置空調系統的冷熱源，充分回收利用醫療建筑產生的廢水、廢熱，采用新的空調節能技術，不斷改進現有空調設備的性能，提高手術室空調系統的運行管理水平，從而不斷降低層流手術室空調系統的能源消耗。